上坂 将弘

職歴

2022年9月 – 現在東北大学 大学院生命科学研究科 動物発生分野 助教
2018年4月 – 2022年8月理化学研究所 生命機能科学研究センター 形態進化研究チーム 研究員
2015年4月 – 2018年3月東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻 日本学術振興会 特別研究員 (PD)
2012年4月 – 2015年3月京都大学大学院 理学研究科 生物科学専攻 日本学術振興会 特別研究員 (DC1)

学歴

2015年3月京都大学大学院 理学研究科 博士課程修了 (阿形 研究室)
2013年4月 – 2015年3月九州大学大学院 医学研究院 (中島 研究室) 指導委託
2012年3月京都大学大学院 理学研究科 修士課程修了 (阿形 研究室)
2010年3月京都大学 理学部 卒業
2006年3月福井県立武生高等学校 卒業

論文・出版物

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研究助成金

  • 2023年4月 – 2024年3月
    2023年度 水産無脊椎動物研究所 個別研究助成
    棘皮動物バフンウニの後期発生における遺伝子発現制御の反復傾向検証
  • 2022年12月
    令和4年度 東北大学 大学院生命科学研究科奨励賞
    棘皮動物の胚発生における反復傾向の検証から迫る発生と進化の一般則理解
  • 2022年4月 – 2025年3月
    科学研究費助成事業 若手研究 代表
    脊椎動物器官発生における遺伝子制御活性解析による進化と発生の反復傾向の実体解明
  • 2017年6月 – 2022年3月
    科学研究費助成事業 新学術領域研究 (研究領域提案型; 計画班分担)
    脊索動物胚発生の分子発生システムゆらぎ測定と進化的保存性
  • 2018年4月 – 2021年3月
    科学研究費助成事業 若手研究 代表
    脊椎動物における進化と発生の反復傾向の検証に向けた発生時系列の遺伝子制御動態解析
  • 2015年4月 – 2018年3月
    科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 (PD) 代表
    終脳発生の進化的多様性の起源解明に向けた比較オミックス解析
  • 2012年4月 – 2015年3月
    科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 (DC1) 代表
    偽遺伝子挿入による種特異的非コードRNA獲得に基づく哺乳類エピゲノム進化

学会発表 (口頭発表のみ)

国際学会

  • The developmental hourglass model and the vertebrate body plan conservation: insights from single-cell level transcriptome analysis The 3rd AsiaEvo Conference. Dec. 2023
  • Does vertebrate embryogenesis recapitulate its evolutionary history? The 2nd AsiaEvo Conference. Aug. 2021
  • [Organized] Testing the recapitulative pattern in vertebrate embryogenesis from the perspective of gene regulation. JSDB Online Trial Meeting 2020. Sep. 2020

国内発表

  • [Invited] 比較オミクス解析から迫る個体発生と進化の関係性. NGS EXPO 2023. Nov. 2023
  • 脊椎動物発生のオープンクロマチン動態に見られた系統進化の反復的パターン. 第42回 日本分子生物学会年会. Nov. 2019
  • [Invited] 脊椎動物の胚発生における反復説の検証. 日本動物学会第90回大阪大会. Sep. 2019
  • [Organized] 脊椎動物の発生過程は進化を反復するのか? 日本進化学会第21回大会. Aug. 2019
  • Species-specific pseudogene insertions generate cis-acting RNA for promoter demethylation in the macaque. 第35回日本分子生物学会年会. Dec. 2012
  • マカクザルにおける偽遺伝子由来promoter-associated noncoding RNA (pancRNA) による種特異的転写活性化. 第104回 日本繁殖生物学会大会. Sep. 2011
  • マウス・サル脳における種特異的promoter-associated noncoding RNAの同定. RNAフロンティアミーティング2010. Sep. 2010
  • マウス・サル脳における種特異的promoter-associated noncoding RNAの同定. 第102回 日本繁殖生物学会大会. Aug. 2009

シンポジウム企画

  • Genomic Inference of Gene Regulatory Networks Underlying Development, Regeneration, and Evolution. JSDB Online Trial Meeting 2020. Sep. 2020
  • 表現型進化を制約しうる発生基盤. 日本進化学会 第22回 オンライン大会. Sep. 2020
  • Genomic Inference of Gene Regulatory Networks Underlying Development, Regeneration, and Evolution. The 53rd JSDB-APDBN Meeting. May. 2020
  • 発生がもたらす進化の方向性. 日本進化学会第21回大会. Aug. 2019

メディア / プレスリリース

査読経験

  • Current Opinion in Genetics & Development
  • Journal of Experimental Zoology, Part B (Guest associate editor)
  • Molecular Biology and Evolution

所属学会

  • 日本進化学会
  • 日本発生生物学会
  • 日本分子生物学会